بناءً على قرار مجلس الوزراء رقم (412) وتاريخ 1441/06/17هـ المتضمن إلغاء وحدات المتابعة بالأجهزة الحكومية وإسناد بعض من مهامها إلى وحدة المراجعة الداخلية أصدر معالي رئيس الجامعة (حفظه الله) القرار رقم (410501032) وتاريخ 1441/06/29هـ المتضمن دمج كلاً من إدارة المتابعة والرقابة الإدارية ووحدة المراجعة الداخلية معاً في إدارة واحدة بمسمى (إدارة المراجعة الداخلية). ووجه معاليه بأن تكون إدارة المراجعة الداخلية في جامعة جدة أداة لمراجعة الإجراءات المالية والإدارية والتحقق من إتباع الأنظمة واللوائح، كما تقوم الإدارة بأعمال الرقابة والمراجعة لكافة قطاعات الجامعة وتقييم أداء الأعمال الإدارية والمالية والتأكد من تطبيق اللوائح الداخلية في الجامعة واستخدام الموارد بكفاءة وفعالية.